專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。適用裝載肉類、水果等貨物。冷藏集裝箱造價較高，營運費用較高，使用中應注意冷凍裝置的技術狀態(tài)及箱內貨物所需的溫度。

冷藏集裝箱可用于多種交通運輸工具進行聯運
可以從產地到銷售點，實現“國到國”直達運輸，
一定條件下，可以當作活動式冷庫使用

冷藏集裝箱的水果的低設定溫度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷凍貨物通常被認為是“惰性(inert)”貨物，一般在-18℃（0°F）或更低溫度下運載。既然冷藏和冷凍貨物都是易腐爛的，就注意確保這類貨物以佳狀態(tài)交付。對于冷藏貨物，除了有限的幾種例外情況（比如肉，巧克力，膠片，化學物品，奶制品，人工氣調儲藏運輸貨物）外，其通風設備通常要保持開啟狀態(tài)。

二手冷藏集裝箱具有隔熱性強、氣密性強和可維持低溫的特點，可控溫度范圍零下-25℃~＋25℃之間，可以用于陸運，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱，它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱，可持續(xù)保溫72小時以上，適合裝載海鮮、生肉、蔬菜、水果、飲料、藥品、易腐蝕食品、化工原料等。

人們常用二手冷藏集裝箱運輸和保存易腐蝕貨物（蛋白質制品或新鮮水果和蔬菜）。在日常使用中，很多人稱它為“凍柜”，誤認為它跟家用冰箱一樣，可以在短時間內完全冷凍貨物并長時間保持。實際上，這種認知是錯誤的，只對了其中一半。

冷藏集裝箱出租是指集裝箱增加了冷藏功能后對外出租的一種方式，早期很多食品兩地運輸的距離過長，路上花的時間過久導致變質損壞，慢慢的人們就在集裝箱里面增加了冷藏功能，這就是冷藏集裝箱的來源。現在陸運或者海運冷藏集裝箱的使用率都很高，已經變成了一種通用的運送工具。