項(xiàng)目簡(jiǎn)介：
RNA 甲基化指發(fā)生在RNA 分子上不同位置的甲基化修飾現(xiàn)象，常見(jiàn)的RNA轉(zhuǎn)錄后修飾方式有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine，m6A) 和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine，m5C)等。
新研究發(fā)現(xiàn)，m6A修飾在調(diào)控基因表達(dá)、剪接、RNA 編輯、RNA 穩(wěn)定性、控制mRNA壽命和降解、介導(dǎo)環(huán)狀RNA翻譯等方面扮演重要角色。因此meRIP-seq助力解決細(xì)胞分化，生物發(fā)育、疾病發(fā)展，熱休克反應(yīng)等生物學(xué)問(wèn)題。
利用甲基化RNA共沉淀結(jié)合高通量測(cè)序 (Methylated RNA Immunoprecipitation sequening，MeRIP-seq)技術(shù)，可以對(duì)RNA轉(zhuǎn)錄后甲基化修飾圖譜進(jìn)行全面研究，是表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的關(guān)鍵技術(shù)。

項(xiàng)目流程：
甲基化RNA共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation，MeRIP)基于抗體特異性結(jié)合甲基化修飾的堿基的原理，以RNA共沉淀富集甲基化修飾片段為基礎(chǔ)，然后通過(guò)高通量測(cè)序，在全轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)研究發(fā)生甲基化的RNA區(qū)域，獲得結(jié)果。



客戶(hù)提供：
1、活細(xì)胞：培養(yǎng)細(xì)胞至60－80％密度，然后加滿(mǎn)培養(yǎng)基寄給公司；
2、物種信息（人、大小鼠物種，其他物種需評(píng)估）

基本分析內(nèi)容：
1、 原始數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)
2、過(guò)濾后數(shù)據(jù)質(zhì)量QC 圖
3、測(cè)序序列與參考基因組比對(duì)
4、基因組覆蓋度分布
5、Peak Calling 分析
6、Peak 可視化
7、Peak 統(tǒng)計(jì)分析
8、m6A 的基本特征
8.1 peak 在基因元件的分布
8.2 reads 在基因元件的分布
8.3 Peak 關(guān)聯(lián)基因的特征
9、差異peak 分析
10、 motif分析

分析內(nèi)容：
環(huán)狀RNA關(guān)聯(lián)分析

推薦閱讀：RNA甲基化修飾（m6A）研究技術(shù)及方案設(shè)計(jì)

參考文獻(xiàn)：
X, et al.N6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability.Nature. 2014;505(7481):117-20.
2.Liu N, et al.N(6)-methyladenosine-dependent RNA structural switches regulate RNA-protein interactions.Nature. 2015;518(7540):560-4.
3.Yang Y, Fan X, Mao M, et al. Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine[J]. Cell Research, 2017.

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