菊粉是一種由D-果糖經(jīng)β(1→2)糖苷鍵鏈接而成的線性直鏈多糖，分子中約由31個(gè)β-D-呋喃果糖和12個(gè)吡喃菊糖殘基聚合而成，果糖殘基之間能通過(guò)β-2,1-鍵連接。其末端常帶有一個(gè)葡萄糖殘基，聚合度（DP）為260。

干燥的菊粉為白色無(wú)定形粉末，短鏈菊粉比長(zhǎng)鏈菊粉更易溶于水，且溶解度隨溫度的升高而明顯加大。此外，菊粉還具有吸濕性強(qiáng)、能結(jié)合自由水的特點(diǎn)。

菊粉的分子式一般表示為GFn，其中G代表終端葡萄糖單位，F(xiàn)代表果糖分子，n代表果糖的單位數(shù)。需要注意的是，由于菊粉是由多個(gè)果糖分子和少量葡萄糖分子通過(guò)糖苷鍵連接而成的多糖，因此其分子式并不固定，而是一個(gè)表示其組成結(jié)構(gòu)的通式。