1. 植物生長(zhǎng)快、抗病力強(qiáng)：的微生物菌肥，能夠有效的提高植物的抗病能力，加快植物的生長(zhǎng)，提高農(nóng)作物產(chǎn)量。

2. 植物根部發(fā)達(dá)：微生物菌肥中含有大量有機(jī)物質(zhì)，能夠大大改善土壤結(jié)構(gòu)，提高植物根部的發(fā)達(dá)程度，增強(qiáng)植物對(duì)養(yǎng)分的吸收能力。

3. 改善土壤質(zhì)地和肥力：微生物菌肥中含有大量有機(jī)物質(zhì)，能夠在土壤中形成有機(jī)肥料，增加土壤的肥力，改善土壤質(zhì)地，改善土壤的水分和氣味。

4. 降低農(nóng)藥的使用：微生物菌肥中含有大量的微生物，能夠減少農(nóng)藥的使用，延長(zhǎng)植物的生長(zhǎng)期，改善農(nóng)作物的品質(zhì)。

5. ：微生物菌肥可以有效的利用植物的廢棄物，不會(huì)造成環(huán)境污染，是一種綠色的農(nóng)業(yè)肥料。

目前，國(guó)內(nèi)現(xiàn)有的一些畜禽糞便發(fā)酵技術(shù)普遍存在著發(fā)酵，遠(yuǎn)距離運(yùn)輸，集中處理高成本的問(wèn)題。同時(shí)因?yàn)榘l(fā)酵工藝落后，占地面積大，發(fā)酵過(guò)程中因發(fā)酵工藝落后造成地下水的污染和因發(fā)酵不全產(chǎn)生的氣味，使蚊蠅滋生對(duì)周?chē)h(huán)境產(chǎn)生嚴(yán)重影響。同時(shí)發(fā)酵生產(chǎn)受氣候影響嚴(yán)重，雨雪天無(wú)常工作，冬季因低溫導(dǎo)致設(shè)備無(wú)法處理糞便的現(xiàn)象。發(fā)酵時(shí)間普遍長(zhǎng)達(dá)1-2個(gè)月，耗費(fèi)工作人員數(shù)量多。

現(xiàn)在辦理還不太標(biāo)準(zhǔn)，產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)也有待強(qiáng)化。國(guó)家盡管實(shí)行了登記證辦理制度，但辦理力度不行，不少未登記的企業(yè)或產(chǎn)品乃至冒充劣產(chǎn)品還在聲勢(shì)浩大地宣揚(yáng)、出產(chǎn)和出售。別的，對(duì)國(guó)外產(chǎn)品亟待標(biāo)準(zhǔn)，有的國(guó)外產(chǎn)品價(jià)格太高，虛張聲勢(shì)，嚴(yán)峻損害了農(nóng)人利益。